19.6.1964 Ted Kennedy loukkaantui vakavasti lento-onnettomuudessa, jossa lentäjä ja yksi matkustaja saivat surmansa. Ted oli sairaalassa puoli vuotta ja taisteli vaimonsa Virginia Joan Bennettin avustuksella vaalikampanjansa voiton sairaalasta käsin. Onnettomuudessa häneltä meni mm. selkä poikki, puhkesi keuhko, katkesi kylkiluita ja hänellä oli sisäisiä verenvuotoja.

Vuonna 1969 hän joutui auto-onnettomuuteen, jossa hänen sihteerinsä menehtyi.